教職員

兼崎友
( かねさきゆう )

研究支援室研究部門

特任助教

kanesaki.yuh[atmark]shizuoka.ac.jp

054-238-4385

静岡大学教員データベース別ウィンドウが開きます

植物の葉緑体はシアノバクテリア様の細菌の細胞内共生により誕生したと考えられています。細胞内共生を再現することは不可能ですが、多様な種類のシアノバクテリアや、原始的な形質を残す藻類のゲノム情報や制御機構を解析し比較することで、どのようにシアノバクテリアから葉緑体が誕生し得たのかという命題のヒントを探索したいと考えています。またシアノバクテリアは地球上の様々な環境に棲息しており、種内多様性が非常に大きな生物群でもあります。その環境ストレス応答や耐性の機構、あるいは種々の変異株を研究することで、シアノバクテリアのゲノムが持つ環境適応能のポテンシャルを解明したいと考えています。
 

外部資金獲得

[1]. 中等度好熱菌に比肩する高温耐性を獲得した常温性シアノバクテリア適応進化株の解析 (2018年4月〜2021年3月) 基盤研究(C) 代表

[2]. 中等度好熱菌に比肩する高温耐性を獲得した常温性シアノバクテリア突然変異株の解析 (2015年4月〜2018年3月) 基盤研究(C) 代表

[3]. 食用ラン藻スイゼンジノリを用いた細胞外多糖生産分子機構解明 (2015年4月〜2018年3月) 基盤研究(C) 分担

[4]. リシーケンス解析によるラン藻の新規高温耐性遺伝子の探索 (2012年4月〜2015年3月) 若手研究(B) 代表

[5]. 核の光依存的な遺伝子発現制御とレトログレードシグナルの関係解明 (2008年4月〜2009年3月) 奨励研究 代表

論文

[1]. Transcriptional activation of glycogen catabolism and oxidative pentose phosphate pathway by NrrA facilitates cell survival under nitrogen starvation in the cyanobacterium Synechococcus sp. strain PCC 7002.

Plant and Cell Physiology 59/6 1225-1233 2018年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Ehira S

[共著者]Shimmori Y, Kanesaki Y, Nozawa M, Yoshikawa H

 

[2]. Identification of the novel hcbB operon catalyzing the dechlorination of pentachlorophenol in the Gram-positive bacterium Nocardioides sp. strain PD653.

Journal of Pesticide Science 43/2 124-131 2018年) [査読] [国際共著論文] 該当する

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Takagi K

[共著者]Ito K, Matsushima Y, Iwasaki A, Tanaka N, Kanesaki Y, Martin-Laurent F, Igimi S

 

[3]. Mutations responsible for alcohol tolerance in the mutant of Synechococcus elongatus PCC 7942 (SY1043) obtained by single-cell screening system.

Journal of Bioscience and Bioengineering 125/5 572-577 2018年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Hanai T

[共著者]Hirokawa Y, Kanesaki Y, Arai S, Saruta F, Hayashihara K, Murakami A, Shimizu K, Honda H, Yoshikawa H

 

[4]. Intracellular free flavin and its associated enzymes participate in oxygen and iron metabolism in Amphibacillus xylanus lacking a respiratory chain.

FEBS Open Bio 8/6 947-961 2018年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Niimura Y

[共著者]Kimata S, Mochizuki D, Sato J, Kitano K, Kanesaki Y, Takeda K, Abe A, Kawasaki S

 

 [5]. Characterization of mycosporine-like amino acids in the cyanobacterium Nostoc verrucosum.

The Journal of General and Applied Microbiology -/- --- 2018年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Sakamoto T

[共著者]Inoue-Sakamoto K, Nazifi E, Tsuji C, Asano T, Nishiuchi T, Matsugo S, Ishihara K, Kanesaki Y, Yoshikawa H

 

[6]. Draft Genome Sequence of Bacillus licheniformis Heshi-B2, Isolated from Fermented Rice Bran in a Japanese Fermented Seafood Dish.

Genome Announcements 6/10 e00118-18- 2018年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 責任著者

[責任著者]Yu Kanesaki, Sayuri Akuzawa

[共著者]Eri Kubota, Rumi Ohtake, Yukari Higashi, Junko Nagaoka, Tomonori Suzuki

 

[7]. Complete Genome Sequence of the Nonheterocystous Cyanobacterium Pseudanabaena sp. ABRG5-3.

Genome Announcements 6/6 e01608-17- 2018年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Sato N

[共著者]Tajima N, Kanesaki Y, Sato S, Yoshikawa H, Maruyama F, Kurokawa K, Ohta H, Nishizawa T, Asayama M

 

[8]. Draft Genome Sequence of the Nitrogen-Fixing and Hormogonia-Inducing Cyanobacterium Nostoc cycadae Strain WK-1, Isolated from the Coralloid Roots of Cycas revoluta.

Genome Announcements 6/7 e00021-18- 2018年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 責任著者

[責任著者]Yu Kanesaki, Akio Murakami

[共著者]Masaki Hirose, Yuu Hirose, Takatomo Fujisawa, Yasukazu Nakamura, Satoru Watanabe, Shigeru Matsunaga, Hiroko Uchida

 

 [9]. ParA-like protein influences the distribution of multi-copy chromosomes in cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 7942.

Microbiology 164/1 45-56 2018年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Yoshikawa H

[共著者]Watanabe S, Noda A, Ohbayashi R, Uchioke K, Kurihara A, Nakatake S, Morioka S, Kanesaki Y, Chibazakura T

 

[10]. In vitro and in silico characterisation of Lactobacillus paraplantarum D2-1, a starter culture for soymilk fermentation.

International Journal of Food Sciences and Nutrition -/- --- 2018年) [査読] [国際共著論文] 該当する

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Endo A

[共著者]Sasaki F, Maeno S, Kanesaki Y, Hamaguchi Y, Torres GA, Tomita S, Nakagawa J

 

[11]. The 100%-Complete Nuclear and Organellar Genome Sequences of the Ultrasmall Red Algal Species Cyanidioschyzon merolae 10D.

Cyanidioschyzon merolae, A New Model Eukaryote for Cell and Organelle Biology / 61-72 2017年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Hisayoshi Nozaki

[共著者]Yu Kanesaki, Motomichi Matsuzaki, Shunzuke Hirooka

[備考] 総説。紅藻シゾンのセントロメア領域に関する事項やゲノム情報が解読されたことで可能になった解析技法に関する部分を執筆。 DOI: 10.1007/978-981-10-6101-1_5

 

[12]. Control of Cell Nuclear DNA Replication by Chloroplast and Mitochondrion.

Cyanidioschyzon merolae, A New Model Eukaryote for Cell and Organelle Biology / 195-204 2017年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Kan Tanaka

[共著者]Yuki Kobayashi, Yu Kanesaki, Mitsumasa Hanaoka

[備考] 総説。共同研究につき本人担当部分抽出不可能。 DOI: 10.1007/978-981-10-6101-1_13

 

 [13]. Identification of the hcb gene operon involved in catalyzing aerobic hexachlorobenzene dechlorination in Nocardioides sp. strain PD653.

Applied and Environmental Microbiology 83/19 e00824-17 - 2017年) [査読] [国際共著論文] 該当する

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Takagi K

[共著者]Ito K, Takagi K, Iwasaki A, Tanaka N, Kanesaki Y, Martin-Laurent F, Igimi S

 

[14]. Acidophilic green algal genome provides insights into adaptation to an acidic environment.

Proceedings of the National Academy of Sciences USA 114/39 E8304-E8313 2017年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Miyagishima SY.

[共著者]Hirooka S, Hirose Y, Kanesaki Y, Higuchi S, Fujiwara T, Onuma R, Era A, Ohbayashi R, Uzuka A, Nozaki H, Yoshikawa H

 

[15]. Surface Sensing for Paenibacillus sp. NAIST15-1 Flagellar Gene Expression on Solid Medium.

Applied and Environmental Microbiology 83/15 e00585-17- 2017年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Kobayashi K

[共著者]Kanesaki Y, Yoshikawa H

 

[16]. 単細胞紅藻シアニジウム類の多様性と重金属耐性

植物科学の最前線 8/ 135-140 2017年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 責任著者

[責任著者]兼崎

 

[17]. Complete Genome Sequence of a Coastal Cyanobacterium, Synechococcus sp. Strain NIES-970.

Genome Announcements 5/14 e00139-17- 2017年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Kawachi M

[共著者]Shimura Y, Hirose Y, Misawa N, Wakazuki S, Fujisawa T, Nakamura Y, Kanesaki Y, Yamaguchi H

 

[18]. Whole-Genome Sequences of Two Closely Related Bacteria, Actinomyces sp. Strain Chiba101 and Actinomyces denticolens DSM 20671T.

Genome Announcements 5/14 e00126-17- 2017年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 責任著者

[責任著者]Kanesaki Y, Murakami S

[共著者]Ishige T, Sekigawa Y, Kobayashi T, Torii Y, Yokoyama E, Ishiwata H, Hamada M, Tamura T, Azuma R

 

[19]. Conserved two-component Hik34-Rre1 module directly activates heat-stress inducible transcription of major chaperone and other genes in Synechococcus elongatus PCC 7942.

Molecular Microbiology 104/2 260-277 2017年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Tanaka K

[共著者]Kobayashi I, Watanabe S, Kanesaki Y, Shimada T, Yoshikawa H

 

[20]. ゲノム研究の歴史と技術革新

生物工学会誌 95/3 136-139 2017年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 責任著者

[責任著者]兼崎

 

[21]. Variety of DNA Replication Activity Among Cyanobacteria Correlates with Distinct Respiration Activity in the Dark.

Plant and Cell Physiology 58/2 279-286 2017年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Yoshikawa H

[共著者]Ohbayashi R, Yamamoto JY, Watanabe S, Kanesaki Y, Chibazakura T, Miyagishima SY

 

[22]. Genome Mining of Amino Group Carrier Protein-Mediated Machinery: Discovery

 and Biosynthetic Characterization of a Natural Product with Unique Hydrazone Unit.

ACS Chemical Biology 12/1 124-131 2017年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Nishiyama M

[共著者]Matsuda K, Hasebe F, Shiwa Y, Kanesaki Y, Tomita T, Yoshikawa H, Shin-Ya K, Kuzuyama T

 

[23]. CyanoBase: a large-scale update on its 20th anniversary.

Nucleic Acids Research 45/D1 D551-D554 2017年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Nakamura Y

[共著者]Fujisawa T, Narikawa R, Maeda SI, Watanabe S, Kanesaki Y, Kobayashi K, Nomata J, Hanaoka M, Watanabe M, Ehira S, Suzuki E, Awai K

 

[24]. Genomic characterization of a fructophilic bee symbiont Lactobacillus kunkeei reveals its niche-specific adaptation.

Systematic and Applied Microbiology 39/8 516-526 2016年) [査読] [国際共著論文] 該当する

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Endo A

[共著者]Maeno S, Tanizawa Y, Kanesaki Y, Kubota E, Kumar H, Dicks L, Salminen S, Nakagawa J, Arita M

 

[25]. Chloroplast-mediated regulation of CO2-concentrating mechanism by Ca2+-binding protein CAS in the green alga Chlamydomonas reinhardtii.

Proceedings of the National Academy of Sciences USA 113/44 12586-12591 2016年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Fukuzawa H

[共著者]Wang L, Yamano T, Takane S, Niikawa Y, Toyokawa C, Ozawa SI, Tokutsu R, Takahashi Y, Minagawa J, Kanesaki Y, Yoshikawa H

 

[26]. Draft Genome Sequences of Bradyrhizobium elkanii Strains BLY3-8 and BLY6-1, Which Are Incompatible with Rj3 Genotype Soybean Cultivars.

Genome Announcements 4/5 e01169-16- 2016年) [査読] [国際共著論文] 該当しな

 [責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Yamakawa T

[共著者]Zaw Htwe A, Kanesaki Y, Yoshikawa H, Tsurumaru H

 

[27]. Genetic Analysis of Collective Motility of Paenibacillus sp. NAIST15-1.

PLoS Genetics 12/10 e1006387- 2016年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Kobayashi K

[共著者]Kanesaki Y, Yoshikawa H

 

[28]. Draft Genome Sequence of Microbacterium sp. Strain HM58-2, Which Hydrolyzes Acylhydrazides.

Genome Announcements 4/3 e00554-16- 2016年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Yajima S

[共著者]Ishige T, Kanesaki Y, Ito S, Oinuma K, Takaya N, Sasaki Y

 

[29]. Draft Genome Sequence of Paenibacillus amylolyticus Heshi-A3, Isolated from Fermented Rice Bran in a Japanese Fermented Seafood Dish.

Genome Announcements 4/2 e00218-16- 2016年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 責任著者

[責任著者]Kanesaki Y, Akuzawa S

[共著者]Nagaoka J, Kanekatsu M, Kubota E, Ohtake R, Suzuki T

 

[30]. Diversification of DnaA dependency for DNA replication in cyanobacterial evolution.

The ISME Journal 10/5 1113-1121 2016年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Yoshikawa H

[共著者]Ohbayashi R, Watanabe S, Ehira S, Kanesaki Y, Chibazakura T

 

[31]. Complete genome sequence of cyanobacterium Fischerella sp. NIES-3754, providing thermoresistant optogenetic tools.

Journal of Biotechnology 220/ 45-46 2016年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

 [責任著者・共著者の別] 責任著者

[責任著者]Kanesaki Y, Hirose Y

[共著者]Fujisawa T, Ohtsubo Y, Katayama M, Misawa N, Wakazuki S, Shimura Y, Nakamura Y, Kawachi M, Yoshikawa H, Eki T

 

[32]. Draft Genome Sequence of Oceanobacillus picturae Heshi-B3, Isolated from Fermented Rice Bran in a Traditional Japanese Seafood Dish.

Genome Announcements 4/1 e01621-15- 2016年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Akuzawa S, Suzuki T

[共著者]Nagaoka J, Kanekatsu M, Kanesaki Y

 

[33]. Complete genome sequence of cyanobacterium Nostoc sp. NIES-3756, a potentially useful strain for phytochrome-based bioengineering.

Journal of Biotechnology 218/ 51-52 2016年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 責任著者

[責任著者]Kanesaki Y, Hirose Y

[共著者]Fujisawa T, Ohtsubo Y, Katayama M, Misawa N, Wakazuki S, Shimura Y, Nakamura Y, Kawachi M, Yoshikawa H, Eki T

 

[34]. Identification of the Three Genes Involved in Controlling Production of a Phytotoxin Tropolone in Burkholderia plantarii.

Journal of Bacteriology 198/11 1604-1609 2016年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Utsumi R

[共著者]Miwa S, Kihira E, Yoshioka A, Nakasone K, Okamoto S, Hatano M, Igarashi M, Eguchi Y, Kato A, Ichikawa N, Sekine M, Fujita N, Kanesaki Y, Yoshikawa H

 

[35]. Complete Genome Sequence of Cyanobacterium Leptolyngbya sp. NIES-3755.

Genome Announcements 4/2 e00090-16- 2016年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 責任著者

[責任著者]Kanesaki Y, Hirose Y

[共著者]Fujisawa T, Ohtsubo Y, Katayama M, Misawa N, Wakazuki S, Shimura Y,

Nakamura Y, Kawachi M, Yoshikawa H, Eki T

 

[36]. Analysis of spontaneous suppressor mutants from the photomixotrophically grown pmgA-disrupted mutant in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803.

Photosynthesis Research 126/2-3 465-475 2015年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Hihara Y

[共著者]Nishijima Y, Kanesaki Y, Yoshikawa H, Ogawa T, Sonoike K, Nishiyama Y

 

[37]. Draft Genome Sequence of Bradyrhizobium japonicum Is-1, Which Is Incompatible with Rj2 Genotype Soybeans.

Genome Announcements 3/5 e01219-15- 2015年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Yamakawa T

[共著者]Sakata T, Kanesaki Y, Yoshikawa H, Tsurumaru H

 

[38]. Intensive DNA Replication and Metabolism during the Lag Phase in Cyanobacteria.

PLoS One 10/9 e0136800- 2015年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Yoshikawa H

[共著者]Watanabe S, Ohbayashi R, Kanesaki Y, Saito N, Chibazakura T, Soga T

 

[39]. A Putative Type III Secretion System Effector Encoded by the MA20_12780 Gene in Bradyrhizobium japonicum Is-34 Causes Incompatibility with Rj4 Genotype Soybeans.

Applied and Environmental Microbiology 81/17 5812-5819 2015年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Yamakawa T

[共著者]Tsurumaru H, Hashimoto S, Okizaki K, Kanesaki Y, Yoshikawa H

 

[40]. A nitrogen source-dependent inducible and repressible gene expression system in the red alga Cyanidioschyzon merolae.

Frontiers in Plant Science 6/ 657- 2015年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Miyagishima SY

[共著者]Fujiwara T, Kanesaki Y, Hirooka S, Era A, Sumiya N, Yoshikawa H, Tanaka K

 

[41]. Genomic analysis of parallel-evolved cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 under acid stress.

Photosynthesis Research 125/1-2 243-54 2015年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Ohta H

[共著者]Uchiyama J, Kanesaki Y, Iwata N, Asakura R, Funamizu K, Tasaki R, Agatsuma M, Tahara H, Matsuhashi A, Yoshikawa H, Ogawa S

 

[42]. Identification of genes involved in the phosphate metabolism in Cryptococcus neoformans.

Fungal Genetics and Biology 80/ 19-30 2015年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Toh-e A

[共著者]Ohkusu M, Li HM, Shimizu K, Takahashi-Nakaguchi A, Gonoi T, Kawamoto S, Kanesaki Y, Yoshikawa H, Nishizawa M

 

[43]. Identification of centromere regions in chromosomes of a unicellular red alga, Cyanidioschyzon merolae.

FEBS Letters 589/11 1219-1224 2015年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Tanaka K

[共著者]Kanesaki Y, Imamura S, Matsuzaki M

 

[44]. Microevolution of Virulence-Related Genes in Helicobacter pylori Familial Infection.

PLoS One 10/5 e0127197- 2015年) [査読] [国際共著論文] 該当しない

[責任著者・共著者の別] 共著者

[責任著者]Kobayashi I

[共著者]Furuta Y, Konno M, Osaki T, Yonezawa H, Ishige T, Imai M, Shiwa Y, Shibata-Hatta M, Kanesaki Y, Yoshikawa H, Kamiya S