教職員

KimuraHiroyuki

Green Energy Research Division 

Core

Professor

kimura.hiroyuki[atmark]shizuoka.ac.jp

054-238-4784

Kimura LabOpen the other window

 Accretionary prisms are thick sediments. They are observed at convergent plate boundaries around the world; for example Alaska and Washington in the U.S., New Zealand, Chile, Peru, Indonesia, and Taiwan. In Southwest Japan, the accretionary prism situated along the Pacific side is traceable laterally for 1,800 km. The thick sediments are derived from marine sediment; therefore, they are rich in complex organic matter. The sediments contain layers of water-bearing permeable sandstone, and the anaerobic groundwater in the sandstone layers contains natural gas (mainly CH4) and microbial community.

 To reveal microbial metabolisms and material cycles present in the sedimentary layers, a series of geochemical and microbiological studies is performed. We identify the production pathway of CH4 that is reserved in the sedimentary layers. Additionally, we develop a novel bioenergy production system using anaerobic groundwater, CH4, and subterranean microbial communities associated with the accretionary prisms.

 

Finance

[1]. 地下圏微生物による窒素循環:付加体の地下水流動と微生物脱窒のリンケージ解明 (2016年4月) 基盤研究(B) 代表

[2]. 貧栄養環境に生息する細菌群集の生存代謝メカニズムの解明と応用展開 (2013年4月) 若手研究(B) 代表

[3]. 好塩性アーキアがG+C含量の異なるリボソームRNAを使い分ける可能性の追究 (2011年4月) 挑戦的萌芽研究 代表

[4]. 間隙性貝形虫類(甲殻類)にみられる爆発的種分化と祖先的分類群の保存に関する研究 (2009年4月) 基盤研究(B) 分担

[5]. 微生物生育温度推定法を用いた海底熱水域の地下圏微生物の検出と生息深度の解明 (2008年4月) 萌芽研究 代表

Monographs

[1]. Expression and function of different guanine-plus-cytosine content 16S rRNA genes in Haloarcula hispanica at different temperatures
Frontiers in Microbiology 8/ 482- (2017年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]Hiroyuki Kimura
[共著者]Yu Sato, Taketomo Fujiwara, Hiroyuki Kimura
[URL]
[2]. A RuBisCO-mediated carbon metabolic pathway in methanogenic archaea
Nature Communications 8/ 14007- (2017年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当する
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Hiroki Ashida
[共著者] Takunari Kono, Sandhya Mehrotra, Hiroyuki Kimura, Tomohisa Hasunuma, Akiho Yokota

[3]. Regional variation of CH4 and N2 production processes in the deep aquifers of an accretionary prism
Microbes and Environments 31/3 329-338 (2016年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]Hiroyuki Kimura
[共著者]Makoto Matsushita, Shugo Ishikawa, Yuichiro Hirata, Kunio Ozawa, Satoshi Mitsunobu

[4]. 付加体のメタンと地下圏微生物を利用した分散型発電システム
Electronics Communications 31/1 2-8 (2016年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]木村浩之

[5]. Biogas production using anaerobic groundwater containing a subterranean microbial community associated with the accretionary prism
Microbial Biotechnology 8/5 837-845 (2015年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]Hiroyuki Kimura
[共著者]Kyohei Baito, Makoto Matsushita, Miku Otani, Hiroyuki Kimura

[6]. 扉を開く−活躍する若手 "微生物生態学 基礎から応用への挑戦"
日本微生物生態学会誌 29/2 80-82 (2014年) [査読] 無 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]木村 浩之

[7]. 日本微生物生態学会2014年度論文賞について
日本微生物生態学会誌 29/2 97- (2014年) [査読] 無 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]木村 浩之(委員長)
[共著者]重松 亨, 野田悟子, 村瀬 潤, 吉田奈央子

[8]. Thermotoga profunda sp. nov., and Thermotoga caldifontis sp. nov., anaerobic thermophilic bacteria isolated from terrestrial hot springs
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 64/6 2128-2136 (2014年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当する
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Koji Mori
[共著者]Atsushi Yamazoe, Akira Hosoyama, Shoko Ohji, Hiroyuki Kimura, Ken-ichiro Suzuki

[9]. Quantitative analysis of Coenzyme F430 in environmental samples: a new diagnostic tool for methanogenesis and anaerobic methane oxidation
Analytical Chemistry 86/7 3633-3638 (2014年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当する
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Masanori Kaneko
[共著者]Yoshinori Takano, Yoshito Chikaraishi, Makoto Matsushita, Hiroyui Kimura, Naohiko Ohkouchi

[10]. 陸上掘削による地域資源革命 〜付加体の地下圏微生物を利用したメタン・水素ガス生産〜
月刊地球 36/2 101-108 (2014年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]木村 浩之
[共著者]松下 慎, 梅藤恭平, 今井里弥, 津島一平, 大谷実来ほか

[11]. Occurrence and potential activity of denitrifiers and methanogens in groundwater at 140 m depth in Pliocene diatomaceous mudstone of northern Japan
FEMS Microbiology Ecology 86/3 532-543 (2013年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Chie Katsuyama
[共著者]Hiroaki Nashimoto, Kazuyo Nagaosa, Hiroyuki Kimura, Yuichi Suwa, Kenji Kato

[12]. First occurrence of Alviniconcha from Japanese waters (Gastropoda: Provannidae)
Venus 71/3-4 217-219 (2013年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Yoshihiro Fujiwara
[共著者]Takashi Okutani, Hiroyuki Kimura

[13]. Growth temperatures of archaeal communities can be estimated from the guanine-plus-cytosine contents of 16S rRNA gene fragments
Environmental Microbiology Reports 5/3 468-474 (2013年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]Hiroyuki Kimura
[共著者]Kousuke Mori, Toshiro Yamanaka, Jun-Ichiro Ishibashi

[14]. 南西日本の地下圏微生物を利用した付加体エネルギー生産システム
クリーンエネルギー 22/5 27-32 (2013年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]木村浩之

[15]. 付加体の深部地下圏に生息する微生物群集を利用した自立分散型エネルギー生産システム
ケミカルエンジニヤリング 58/5 8-13 (2013年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]木村 浩之

[16]. 付加帯の地下圏微生物を使ったエネルギー生産システム
太陽エネルギー 39/1 15-20 (2013年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]木村 浩之

[17]. 付加帯エネルギー生産システム
配管技術 55/1 31-36 (2013年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]木村 浩之

[18]. 地下圏微生物利用の新エネルギー生産システム
化学装置 54/10 38- 41 (2012年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]木村 浩之

[19]. Hydrogen and carbon isotope fractionation by thermophilic hydrogenotrophic methanogens from a deep aquifer under coculture with fermenters
Geochemical Journal 46/3 193-200 (2012年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Shohei Hattori
[共著者]Hiroaki Nashimoto, Hiroyuki Kimura, Keisuke Koba, Keita Yamada, Mikio Shimizu

[20]. 微生物分子温度計による地下圏の温度プロファイリング
月刊地球 34/4 201-206 (2012年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]木村 浩之

[21]. 地下圏微生物を利用した付加帯エネルギー生産システム
ケミカルエンジニヤリング 57/7 38-41 (2012年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]木村 浩之

[22]. Meiothermus hypogaeus sp. nov., a novel moderately thermophilic bacterium isolated from a Japanese hot spring
INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY 62/1 112-117 (2012年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当する
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Koji Mori
[共著者]Takao Iino, Jun-Ichiro Ishibashi, Hiroyuki Kimura, Ken-Ichiro Suzuki

[23]. Light-induced transcriptional responses associated with proteorhodopsin-enhanced growth in a marine flavobacterium
ISME Journal 5/10 1641-1651 (2011年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当する
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]Hiroyuki Kimura
[共著者]Robert Young, Asuncion Martinez, Edward F. DeLong

[24]. Male dimorphism in a new interstitial species of the genus Microloxoconcha (Podocopida: Ostracoda)
JOURNAL OF CRUSTACEAN BIOLOGY 31/1 142-152 (2011年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Ryouichi Higashi
[共著者]Akira Tsukagoshi, Hiroyuki Kimura, Kenji Kato

[25]. Culture-independent estimation of optimal and maximum growth temperatures of archaea in subsurface habitats based on the G+C content in 16S rRNA gene sequences
GEOMICROBIOLOGY JOURNAL 27/2 114-122 (2010年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]Hiroyuki Kimura
[共著者]Kousuke Mori, Tomokazu Tashiro, Kenji Kato, Toshiro Yamanaka, Jun-Ichiro Ishibashi, Satoshi Hanada

[26]. Population dynamics of Crenarchaeota and Euryarchaeota in the mixing front of river and marine waters
Microbes and Environments 25/2 126-132 (2010年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当する
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Do Manh Hao
[共著者]Tomokazu Tashiro, Miharu Kato, Rumi Sohrin, Chie Katsuyama, Kazuyo Nagaosa, Hiroyuki Kimura

[27]. Microbial methane production in deep aquifer associated with the accretionary prism in Southwest Japan
ISME Journal 4/4 531-541 (2010年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]Hiroyuki Kimura
[共著者]Hiroaki Nashimoto, Mikio Shimizu, Shohei Hattori, Keita Yamada, Keisuke Koba, Naohiro Yoshida, Kenji Kato

[28]. Biomass production and energy source of thermophiles in a Japanese alkaline geothermal pool
ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 12/2 480-489 (2010年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]Hiroyuki Kimura
[共著者]Kousuke Mori, Hiroaki Nashimoto, Shohei Hattori, Keita Yamada, Keisuke Koba, Naohiro Yoshida, Kenji Kato

[29]. In situ biomass production of hot spring sulfur-turf microbial mat
Microbes and Environments 25/2 140-143 (2010年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]Hiroyuki Kimura
[共著者]Kousuke Mori, Hiroaki Nashimoto, Satoshi Hanada, Kenji Kato

[30]. Unique distribution of deep groundwater bacteria constrained by geological setting
Environmental Microbiology Reports 1/6 569-574 (2009年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Kenji Kato
[共著者]Kazuyo Nagaosa, Hiroyuki Kimura, Chie Katsuyama, Katsunori Hama, Takanori Kunimaru, Urumu Tsunogai, Kazuhiro Aoki

[31]. Abundance of Zetaproteobacteria within crustal fluids in back-arc hydrothermal fields of the Southern Mariana Trough
ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 11/12 3211-3222 (2009年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Shingo Kato
[共著者]Katsunori Yamanagawa, Michinari Sunamura, Yoshinori Takano, Hiroyuki Kimura, Akihiko Yamagishi

[32]. Spatial distribution, diversity and composition of bacterial communities in sub-seafloor fluids at a deep-sea hydrothermal field of the Suiyo seamount
DEEP-SEA RESEARCH PART I-OCEANOGRAPHIC RESEARCH PAPERS 56/10 1844-1855 (2009年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Shingo Kato
[共著者]Kurt Hara, Hiroko Kasai, Takashi Teramura, Michinari Sunamura, Jun-ichiro Ishibashi, Takeshi Kakegawa, Toshiro Yamanaka, Hiroyuki Kimura, Katsumi Marumo, Tetsuro Urabe, Akihiko Yamagishi

[33]. (2009)ISSM 2008 国際学会開催報告
日本微生物生態学会誌 24/1 19-21 (2009年) [査読] 無 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]木村 浩之

[34]. Denitrification activity and relevant bacteria revealed by nitrite reductase gene fragments in soil of temperate mixed forest
Microbes and Environments 23/4 337-345 (2008年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Chie Katsuyama
[共著者]Naho Kondo, Yuichi Suwa, Takao Yamagishi, Masayuki Ito, Nobuhito Ohte, Hiroyuki Kimura, Kazuyo Nagaosa, Kenji Kat

[35]. Characteristics of dissolved organic matter in the hydrothermal fluids and the associated water samples obtained from arc-backarc systems
Geochimica et Cosmohimica Acta 72/12 A11-A11 (2008年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Ishibashi, J
[共著者]Akashi, H , Yamanaka, T , Sunamura, M, Kimura, H, Toki, T

[36]. Unique shallow-water hydrothermal system associated with submarine volcanism in the Aira caldera, South Kyushu, Japan
Geochimica et Cosmohimica Acta 72/12 A1052-A1052 (2008年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Yamanaka, T
[共著者]Akashi, H , Maeto, K, Akashi, H, Yokoyama, M, Kimura, H

[37]. Planktonic bacterial population dynamics with environmental changes in coastal areas of Suruga Bay
Microbes and Environments 22/3 257-267 (2007年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Takayuki Takenaka
[共著者]Tomokazu Tashiro, Ayumi Ozaki, Hitomi Takakubo, Yutaka Yamamoto, Tomoko Maruyama, Kazuyo Nagaosa, Hiroyuki Kimura, Kenji Kato

[38]. Phylotype diversity of deep-sea hydrothermal vent prokaryotes trapped by 0.2- and 0.1-um-pore-size filters. Extremophiles
EXTREMOPHILES 11/4 637-646 (2007年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Takeshi Naganuma
[共著者]Tatsuo Miyoshi, Hiroyuki Kimura

[39]. Selective phylogenetic analysis targeting 16S rRNA genes of hyperthermophilic archaea in the deep-subsurface hot biosphere
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 73/7 2110-2117 (2007年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]Hiroyuki Kimura
[共著者]Jun-Ichiro Ishibashi, Harue Masuda, Kenji Kato, Satoshi Hanada

[40]. Composition of archaeal, bacterial, and eukaryal RuBisCO genotypes in three Western Pacific arc hydrothermal vent systems
EXTREMOPHILES 11/1 191-202 (2007年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当する
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Hosam Elsaied
[共著者]Hiroyuki Kimura, Takeshi Naganuma

[41]. Abundance of planktonic thraustochytrids and bacteria and the concentration of particulate ATP in the Greenland and Norwegian Seas
Polar Bioscience 20/ 37-45 (2006年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当する
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Takeshi Naganuma
[共著者]Hiroyuki Kimura, Risa Karimoto, Nikolay V. Pimenov

[42]. 火星の微生物を探せ ! !
日本微生物生態学会誌 21/1 12-13 (2006年) [査読] 無 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]木村浩之

[43]. Seafloor hydrothermal activity at off-axial seamounts of backarc spreading in southern Mariana Trough
Geochimica et Cosmohimica Acta 70/18 A279-A279 (2006年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Ishibashi, J
[共著者]Suzuki, R, Yamanaka, T , Toki, T , Kimura, H, Noguchi, T

[44]. Selective phylogenetic analysis targeted at 16S rRNA genes of thermophiles and hyperthermophiles in deep-subsurface geothermal environments
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 72/1 21-27 (2006年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]Hiroyuki Kimura
[共著者]Maki Sugihara, Kenji Kato, Satoshi Hanada

[45]. Bacterial emdosymbioses of gutless tube-dwelling worms in nonhydrothermal vent habitats
MARINE BIOTECHNOLOGY 7/5 416-428 (2005年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当する
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Takeshi Naganuma
[共著者]Hosam Elsaied, Daiki Hoshii, Hiroyuki Kimura

[46]. Microbial community in a geothermal aquifer associated with the subsurface of the Great Artesian Basin, Australia
EXTREMOPHILES 9/5 407-414 (2005年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当する
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]Hiroyuki Kimura
[共著者]Maki Sugihara, Hiroyuki Yamamoto, Bharat K.C. Patel, Kenji Kato, Satoshi Hanada

[47]. Analysis of dissimilatory sulfite reductase and 16S rRNA gene fragments from deep-sea hydrothermal sites of the Suiyo seamount, Izu-Bonin Arc, Western Pacific
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 70/1 393-403 (2004年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 共著者
[責任著者]Tatsunori Nakagawa
[共著者]Jun-ichiro Ishibashi, Akihiro Maruyama, Toshiro Yamanaka, Yusuke Morimoto, Hiroyuki Kimura, Tesuro Urabe, Manabu Fukui

[48]. Leg193:海底熱水域直下の地下微生物圏-マヌス海盆における海底熱水掘削と微生物分布調査-
月刊地球特集号 号外/40 126-132 (2003年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]木村浩之
[共著者]朝田隆二, 長沼 毅

[49]. Distribution of microorganisms in the subsurface of the Manus Basin hydrothermal vent field, Papua New Guinea
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 69/1 644-648 (2003年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当する
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]Hiroyuki Kimura
[共著者]Ryuji Asada, Andrew Masta, Takeshi Naganuma

[50]. Endosymbiotic microflora of the vestimentiferan tubeworm (Lamellibrachia sp.) from a bathyal cold-seep
MARINE BIOTECHNOLOGY 5/6 593-603 (2003年) [査読] 有 [国際共著論文] 該当しない
[責任著者・共著者の別] 責任著者
[責任著者]Hiroyuki Kimura
[共著者]Yukimasa Higashide, Takeshi Naganuma

Shizuoka University Research Institute of Green Science and Technology

836 Ohya, Suruga-ku,
Shizuoka City, Shizuoka,
422-8529, Japan

TEL:81-54-238-4264
(Japanese only)

FAX:054-238-4312

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